Pikogreen dsDNA定量试剂盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)产品描述
Pikogreen dsDNA 定量试剂盒(Pikogreen HighSensitivity dsDNA Quantitation Kit)不同于常规的基于吸光度的测量,这款试剂盒可以区分dsDNA、ssDNA或RNA,有选择性地检测dsDNA(见图1)。与传统DNA定量方法相比,该产品具有检测范围广、高灵敏度、高特异性等优点。试剂盒主要包含Pikogreen High Sensitivity dsDNA Quantitation Buffer, Enhancer solution以及pre-diluted dsDNA Standards三个组分,可以在200 uL体系内定量0.2-100 ng的dsDNA(见图2)。此外,试剂盒还可以将其他污染物的影响降低至zui低,可以耐受常规污染物例如蛋白质,盐,有机溶剂和洗涤剂等(见表1),该试剂盒不具有细胞膜通透性,没有细胞毒性和诱发突变性,对人体安全无害。
Pikogreen dsDNA定量试剂盒(超敏)(兼容Qubit 3.0) 产品组分
组分
D1101L1127
D1101L1126
A: Pikogreen High Sensitivity dsDNA Quantitation Solution
50 mL
250 mL
B: Pikogreen High Sensitivity dsDNA Enhancer, 100
1 mL
5 mL
C: dsDNA Standards 0 , 0.5, 1, 2 ,4 ,6, 8 and 10 ng/uL dsDNA from calf thymus
每组 0.1 mL(8组)
每组 0.5mL(8组)
技术参数
Ex/Em 485/530nm (结合dsDNA)
运输和保存方法
冰袋运输,4℃避光保存,推荐条件下至少可以储存6个月
Pikogreen dsDNA定量试剂盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)使用方法
1、为了得到zui佳结果,请使用精确校准的移液器和去RNA酶的枪头、试管以及检测板。建议检测时每个DNA标样和未知样品都设定3个复孔。如果检测时不只一块96孔板,建议每块96孔板都设定一条标准曲线,尽量减少检测板之间的误差。
2、使用前,将产品从储存条件下取出恢复至室温。如果100XEnchancer储存液出现沉淀,可37℃水浴溶解。每个组分应充分震荡或涡旋混匀、离心,以免造成不必要的试剂损耗
3、每个待测样品对应200uL的Pikogreen工作液。对于一个96孔板,吸取200uL 100X Enchancer,加入到20mL Quantitation Solution 中,涡旋混匀,配置成Pikogreen工作液,为得到zui佳结果,工作液应在一小时内使用完毕。如果将工作液重新储存并在24小时内使用,结果的准确性会有轻微损失。储存过程中,增强液可能会出现沉淀现象,可以通过涡旋震荡使其重悬。
4、对于每个样品,吸取200 uL的工作液至黑色的96孔板微孔中。为确保结果精确可靠,建议每个测试样品和DNA标样分别做平行的3个复孔,此过程也可以使用有精确量程的移液排枪进行。黑色的检测板可以减少各测试样品间的荧光干扰。
5、在96孔板微孔中,每孔加入10 uL的dsDNA标样或未知样品,并用移液器轻轻混匀。
6、将微孔板室温避光孵育5-10分钟,为得到zui佳结果,孵育结束后,应立即读取检测板。也可以在6小时内读取数据,但结果的精确性会有轻微损失。
7、使用激发波长和发射波长在485 nm和530 nm处的酶标仪测量荧光值。
8、制作一条标准曲线,计算检测样品的DNA浓度(见图2)。
注:图2标准曲线仅供参考,您可以根据实际测得的数据自制标准曲线,从而求算样品的浓度。
图1:使用Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量试剂盒检测不同类型核酸得到的相对荧光强度
图2:使用Pikogreen Hig Sensitivity dsDNA 定量试剂盒制作的calf thymus DNA标准曲线(Ex/Em 485/530),左上角插图显示了低浓度DNA样本测定的曲线图。
Pikogreen dsDNA定量试剂盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)注意事项
1、对于要检测的植物或动物来源的DNA样本,小牛胸腺DNA(Calf thymus DNA )常常作为制作DNA标样的参照物。因为Calf thymus DNA具有双链结构、高度聚合,碱基分配均匀(AT含量58%,GC42%)。如果检测样品的荧光值超过了标准曲线,那么需要将样品做进一步稀释处理。为了保持结果的一致性,务必使每孔上样量均等,且不含有其他高浓度的污染物。
2、Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量试剂盒可以测量范围在0.2-100 ng的dsDNA。对于一些不需要线性检测的样品,试剂盒检测范围可以扩展至200 ng。如需检测更低含量的样品,您可以将DNA标样用1 TE缓冲液作进一步的稀释,浓度可以稀释到0.02 ng/uL,然后按照常规程序每孔10 uL上样。
3、对于不同种类的检测仪器,您可以优化仪器设置,以获取zui佳线性度。一些可能会影响zui终线性度和相对荧光强度的因素有(1)激发和发射波长与带宽;(2)截止型滤波器;(3)灵敏度设置;(4)移液的准确性;(5)微孔板制造商。
4、附表1. 详细列出了几种常见的DNA污染物,如盐、溶剂、洗涤剂和蛋白质等。
附表1. 常见的DNA污染物对 Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量试剂盒的影响
复合物
初始浓度
终浓度(200uL)
结果
醋酸铵
100 mM
5 mM
Pass
醋酸钠
600 mM
30 mM
Pass
氯化钠
200 mM
10 mM
Pass
氯化镁
25 mM
1.25 mM
Pass
苯酚
2 %
0.1 %
Pass
乙醇
10 %
0.5 %
Pass
chlorofrom
2 %
0.1 %
Pass
十二烷基硫酸钠(SDS)
0.2 %
0.01 %
Pass
Triton X-100
0.2 %
0.01 %
Pass
牛血清白蛋白(BSA)
200 mg/mL
10 mg/mL
Pass*
dNTPs**
2 mM
100 uM
Pass
聚乙二醇
40 %
2 %
Pass
琼脂糖
2 %
0.1 %
Pass
注:三份dsDNA平行样品的标准曲线,分别在上述含有指定浓度污染物的条件下(初始浓度进行检测, Pass 指与没有污染物的体系相比较,实验结果变化范围 20%。所有样品用Molecular DevicesGemini XS酶标仪在485 nm处激发,在530 nm处测荧光强度。 Pass * 指由此条件测得的标准曲线有少许变动。 dNTPs** 指dATP, dCTP, dGTP, dTTP的混合物。