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Rubicon Genomics测序文库(illumina平台)-技术文章-华雅再生医学生物工程技术有限公司

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放大字体  缩小字体    发布日期:2019-09-02  来源:仪器信息网  作者:Mr liao  浏览次数:697
核心提示:Rubicon拥有ThruPLEX 和PicoPLEX 技术。特殊的引物或接头设计,能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。ThruPLEXRubicon ThruPLEX和所有illumina NGS平台兼容。ThruPLEX DNA-seq Kit是通用性较高的试剂盒,适合全基因组测序、全外显子测序、靶向测序和ChIP-Seq的文库构建。ThruPLEX Plasma-seq是血浆游离DNA的专用试剂盒,适用液体活检相关(循环肿瘤DNA和无创产前检测:母体血浆胎儿游离DNA)的基因文库构建。Thru

Rubicon拥有ThruPLEX 和PicoPLEX 技术。特殊的引物或接头设计,能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。

 

 

ThruPLEX

Rubicon ThruPLEX和所有illumina NGS平台兼容。ThruPLEX DNA-seq Kit是通用性较高的试剂盒,适合全基因组测序、全外显子测序、靶向测序和ChIP-Seq的文库构建。

ThruPLEX Plasma-seq是血浆游离DNA的专用试剂盒,适用液体活检相关(循环肿瘤DNA和无创产前检测:母体血浆胎儿游离DNA)的基因文库构建。

ThruPLEX Tag-seq Kit能提供1600万以上的分子标签(Unique Molecular Tags),结合靶向序列富集系统,适合稀有变异等位基因检测。

 

PicoPLEX 

Rubicon PicoPLEX 采用技术,设计优化用于从单细胞中扩增全基因组DNA,适用植入前胚胎基因筛查和诊断(PGS,PGD)。

PicoPLEX WGA Kit不能直接应用NGS,PicoPLEX DNA-seq Kit可以直接应用illumina NGS平台。

 

Rubicon ThruPLEX 和PicoPLEX 两种技术都有独特的自配对茎环形DNA fragment,能减少基因扩增时假阳性、假阴性和非特异性扩增的发生。

 

单细胞文库构建-Rubicon

ThruPLEX DNA-seq Kit

更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina 的 NGS 平台

更高的通量 多达 96 个 index

微量起始样品(50 pg 50 ng),更高性能

快速简单的实验方法:一根管或孔中,仅三步反应,约 2 小时时间,无需转移

适用于所有主要的靶向富集平台 安捷伦 SureSelect Enrichment,罗氏 NimbleGen SeqCap EZ ,IDT xGEN LockDown probes

 

ThruPLEX Plasma-seq Kit

专为血浆游离DNA设计

专为cfDNA设计:修复及连接试剂配方更新,方法优化

高品质NGS文库:在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性

起始量范围广:<1 ng到30 ng cfDNA量

快速简便:单管、2小时、3步操作步骤,无需纯化或样品转移步骤

应用领域:液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建

兼容自动化平台:Beckman FXP Workstation

 

ThruPLEX Tag-seq Kit

设计用于靶向序列的超深度测序

可信赖的实验结果。ThruPLEX Tag-seq技术提供了多达1,600万个分子标签来纠正测序误差,提供可信的变异检测分析。

发现更多,成本更低。结合基于杂交技术的目标序列富集系统可分析数百个基因,同时分析突变和结构变异。

每次都可获得高质量文库。单管操作,2小时,3步操作流程。使用简便,可减少使用者操作误差和污染发生。

省时的生物信息学分析方案。采用Curio Genomics提供的云服务软件或开源软件可以快速获得研究结果。

珍贵样品分析成为可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的样品也可以分析了。ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多种样品类型。

 

ThruPLEX系列型号选择

 

试剂盒

应用

特点

样品

ThruPLEX DNA-seq

通用DNA扩增试剂盒。应用范围广。文献常见应用:ChIP-Seq。

有多种索引选择。

50pg-50ng

gDNA、cDNA、FFPE DNA、ChIP DNA

ThruPLEX  Plasma-seq

肿瘤或其他疾病无创检测,母体血浆中胎儿游离DNA分析

优化了模版修复和文库合成步骤,适用血浆游离DNA(短又变性的DNA fragment)。

 

血浆、尿液、液体活检1ng-30ng cell-free DNA

ThruPLEX Tag-seq

肿瘤或其他疾病中稀有变异等位基因检测。

茎环形接头包含了分子标签连接DNA fragment两端。

 

1ng-50ng

gDNA、cell-free DNA、FFPE DNA

 

PicoPLEX DNA-seq Kit

单细胞 DNA 文库制备技术,适用于 Illumina 所有 NGS 测序平台

减少歧义-可高度重复性地检测基因组拷贝数变异(CNV)和非整倍性

减少工作流程-从一个单细胞到制备 DNA 测序文库仅仅三个步骤

降低成本-单一试剂盒包含制备一个测序文库所需要的所有材料

减少污染和错误-在一个单一的管或孔中完成文库制备所有流程,不需要转移 DNA 样品

减少反应时间- 制备 Illumina NGS 文库不到3个小时

 

PicoPLEX WGA Kit

用于单细胞文库构建的全基因组扩增解决方案

单细胞研究结果可高度重复(或 15 pg DNA )

再现性良好的等位基因显示

易于使用和高度自动化

在所有分辨率下,结果清晰

 

Rubicon 试剂订购信息

 

品牌

货号

新货号

产品描述

包装

Rubicon

RB4406

R400406

ThruPLEX DNA-seq 48D Kit

ThruPLEX通用文库构建试剂盒

48Rxns

Rubicon

RB4407

R400407

ThruPLEX DNA-seq 96D Kit

ThruPLEX通用文库构建试剂盒

96Rxns

Rubicon

RB4427

R400427

ThruPLEX DNA-seq 48S Kit

ThruPLEX通用文库构建试剂盒

48Rxns

Rubicon

RB4428

R400428

ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit

ThruPLEX通用文库构建试剂盒

48Rxns

Rubicon

RB4523

R400523

ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit

ThruPLEX通用文库构建试剂盒

12Rxns

Rubicon

RB4490

R400490

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

ThruPLEX血浆测序试剂盒

12Rxns

Rubicon

RB4491

R400491

ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit

ThruPLEX血浆测序试剂盒

48Rxns

Rubicon

RB4492

R400492

ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit

ThruPLEX血浆测序试剂盒

96Rxns

Rubicon

RB4584

R400584

ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit

12Rxns

Rubicon

RB4585

R400585

SMARTer ThruPLEX Tag-seq 48S Kit

48Rxns

Rubicon

RB4586

R400586

SMARTer ThruPLEX Tag-seq 96D Kit

96Rxns

Rubicon

RB3050

R30050

PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用

50Rxns

Rubicon

RB3381

R300381

PicoPLEX DNA-seq Kit,48种双端illumina indexes

48Rxns

 

Rubicon公司成立于2000年,总部位于美国密歇根州。产品都拥有技术,检控严格,拥有cGMP级生产能力,是单细胞测序文库构建的。2017年1月,Rubicon 成为Takara的一员,并且发展良好。

 

华雅旗下红荣微再(上海)生物工程技术有限公司2018年,与TAKARA继续合作,授权代理(上海)Rubicon和Cellartis 试剂。红荣微再以 传递科学价值,服务科学研究 为宗旨,主营干细胞、医疗、细胞治疗、器官再生四大板块的产品。

手机1500 1904 520 红荣微再-客服  经销商专员

 

 
 
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