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(一)对脑血流和颅内压的作用与副作用
呼吸机机械通气通过降低PaCO2和升高Pa02来减少脑血流量，使颅内压下降。脑水肿的患者可通过轻度的过度通气来降低颅内压。
机械通气通过PaO2升高来改善缺氧，避免发生脑功能障碍。
PEEP设置过高将作用与副作用颈内静脉的回流，导致颅内压进一步升高。因此，颅内高压的患者应尽量避免使用PEEP，必须使用时，建议PEEP 5cmH201
(二)对肾脏的作用与副作用
呼吸机正压通气时，胸腔内压力升高，回心血量减少，心排出量下降，引起肾血液流量减少，造成尿量减少。但只要肾小球毛细血管的压力不低于75mmHg，机体将通过代偿机制保持尿量不变。机械通气时，将发生肾脏内部血流的再分布，可导致肾功能的改变。
正压通气时，心排出量下降，引起左心房内的容量感受器和颈动脉窦的压力感受器兴奋，高利尿激素的释放增加，引起尿量减少，可导致水钠的潴留。
(三)对肝脏的作用与副作用
呼吸机通气通过纠正缺氧和二氧化碳潴留，改善肝脏的功能。这是有利之处。
长时间通气时，如果参数设置不当，可使肝脏的动脉血流减少，门静脉压力升高，静脉回流受阻，导致肝淤血，可引起肝功能损伤和肝肿胀。
(四)对消化系统的作用与副作用
机械通气通过纠正缺氧和二氧化碳，减轻胃肠道翁膜的损伤和消化道出血，起到保护胃肠道功能的作用。
机械通气的正压影响了下腔静脉的回流，也可引起消化道出血和损伤。通气时胆汁反流、胃肠道pH值下降可损伤胃钻膜上皮。机械通气还可引起腹胀、胃肠道充血。
(五)对酸碱平衡的作用与副作用
机械通气通过纠正缺氧和二氧化碳潴留，对酸碱失衡的治疗作用是肯定的。但如果参数设置不当，也会加重酸碱失衡。
1、通气不足的影响
如果呼吸机参数设置不当，可发生机械通气不足，使PaCO2升高，pH值呈酸性，并伴有低氧血症，导致呼吸性酸中毒。发生呼吸性酸中毒时，将刺激患者的自主呼吸，以试图补充通气不足，就会出现人机对抗。
2、通气过度的影响
如果机械通气过度，使PaC02下降，pH值呈碱性，可导致呼吸性碱中毒。发生呼吸性碱中毒时，将降低对患者的自主呼吸的刺激，有助于减弱人机对抗。
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