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1、细胞破碎 包括珠磨破碎、压力释放破碎、冷冻加压释放破碎、化学破碎、机械粉碎等，细胞破碎技术的成熟使得大规模生产胞内产物成为可能。
2、初步纯化 各种沉淀法如盐析法、有机溶剂沉淀、化学沉淀，大网络树脂吸附法、膜分离法解决了对热、PH、金属离子、有机溶剂敏感的大分子物质的分离、浓缩和脱盐等难题。
3、高度纯化 开发了各类层析技术，如亲和层析、疏水层析等，而用于工业化生产的主要是离子交换层析和凝胶层析。前一种技术是20世纪60年代以后逐渐发展成为工业技术的，真正用于生物大分子的他离是20世纪70年代以后各种类型的弱酸、弱碱型离子交换树脂，如DEAE-葡聚糖等材料商品化后才有了迅速的发展。凝胶层析技术的工业应用是20世纪80年代才实现的。
4、成品加工 主要是干燥与结晶。对于生物活性物质，可根据其热稳定性的不同分别采用喷雾干燥、气流干燥、沸腾床干燥、冷冻干燥等技术。其中冷冻干燥技术在蛋白质产品的干燥上广为应用，但其能耗高、设备复杂、操作时间长，因此有待完善和改进;结晶技术实现了工业化生产。
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