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轮虫的作用主要是在其他水产品种育苗时作为食物或替代食物，比如河蟹育苗，如果轮虫繁育的不成功，那么河蟹育苗就肯定失败。而罗氏沼虾育苗过程中，轮虫是替代部分丰年虫的好东西。可作为废水处置效果的指示生物。当活性污泥中出现轮虫时，废水生物处置过程中轮虫为自由生活和固着生活种类。标明处置效果良好，但如数量太多，则有可能破坏污泥的结构，使污泥松散而上浮。活性污泥中常见的轮虫有转轮虫(Rotariarotatoria红眼旋轮虫等。轮虫在水源水中大量繁殖时，有可能阻塞水厂的砂滤池。
种类多，轮虫是一群微小的多细胞动物。广泛分布于淡水、半咸水和海水中。其对环境适应性强、繁殖快、营养丰富、大小适中、易培养，鱼、虾、蟹幼体理想的动物性饵料，目前广泛应用于生产性培养的褶皱臂尾轮虫。轮虫(Rotif多细胞动物中比较简单的一种，分类位置为担轮动物门(Trochelminith轮虫纲(Rotifera形体微小，长度约44000 m多数在500 m左右。身体长形，前端有一个头冠，头冠上有纤毛环，轮虫纤毛环摆动时如旋转的轮盘并因此而得名。纤毛环摆动时，将细菌和有机颗粒等引入口部，纤毛环还是轮虫的运动器官。轮虫有个体的也有群体的
大多自由生活和固着生活，轮虫均为水生。寄生种类极少。轮虫主要生活在河流、池沼，甚至雨后的积水等淡水环境中，海水中较少。轮虫的食物主要是细菌、霉菌、原生动物、藻类以及有机颗粒，当它水中大量繁殖时，对水体可以起自净作用，使水质变得澄清。轮虫在生物界的食物链中所起的作用也很重要。还是一些淡水鱼类的主要和良好的饵料，与鱼类的养殖有直接的关系。
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