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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
品牌：Rubicon Genomics
货号：R300669
规格：24Rxns
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA测序文库构建
单细胞起始的DNA测序文库构建
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit
高重现性和准确性：可用于CNV、SNV和非整倍体检测
在SNV和CNV检测方面优于MDA技术
三小时的工作流程，手动操作时间不到30分钟
均匀的高覆盖率，低的等位基因插入率和脱扣率
应用：
适用于以下细胞类型的文库制备：
癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
以及细针抽吸（FNA）细胞；
生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。
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产品说明：SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq KitSMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一种旨在从单细胞中生成高质量的DNA文库，以便在Illumina平台进行测序的试剂盒。该试剂盒基于PicoPLEX技术，优化用于检测拷贝数变异 (CNVs)、单核苷酸变异 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和结构变异 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV检测中表现出比MDA技术更好的性能。SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要单独购买。
PicoPLEX WGA是一种在全球被广泛用于检测单细胞中CNV的全基因组扩增（WGA）技术。最初，PicoPLEX技术主要用于高再现性的检测非整倍体异倍性和CNV。为了满足准确检测SNV的需求，对PicoPLEX WGA技术中的酶、引物和protocols进行了进一步优化，不仅提升了扩增的覆盖度、一致性、准确性，同时提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重现性。
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定细胞或非固定细胞起始，只需简单的4步操作流程，即可在3小时内完成Illumina NGS文库的构建，且手动操作时间非常短。
SMARTer DNA HT dual index kits
SMARTer DNA HT dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含Illumina Nextera XT v2 index序列对应的index引物，最多可提供384种不同的双端index，用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个的不同条形码标记的index微孔板中，每个微孔板可提供不同的96种index组合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每个孔提供的量足够进行一次测序反应；另一种是一套中有24个单独的反应管，每个反应管中包含不同的双端index组合（Code No.R400664），且每个反应管（24N）提供的量足够进行两次测序反应。SMARTer DNA unique dual index kits
SMARTer DNA unique dual index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含 IDT for Illumina UD 对应的index引物，最多可提供96种不同双端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中，其中每组可提供24种不同index引物组合（Code No.R400665-R400668）。每个index引物管（24U Sets A-D）提供的量足够进行两次测序反应。SMARTer DNA single index kits
SMARTer DNA single index kits是与SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与 TruSeq LT set A 序列对应的index引物，可提供24种单端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中，其中每组可提供12种不同index引物组合（Code No.R400695和R400697）。每个index引物管（12U Sets A-B）提供的量足够进行8次测序反应。欢迎您致电 重庆市华雅干细胞技术有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229
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图1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技术。PicoPLEX Gold的技术概要。通过step1裂解细胞获得gDNA，通过随机引物进行预扩增 (step 2)，然后进行指数扩增得到测序文库（step 4）。 图2. PicoPLEX Gold的主要特点：高覆盖度，高均匀性，和高重现性 (与A产品技术相比)。
Panel A. 图中显示在不同深度的测序中覆盖的碱基数 (～35M read pairs，PE 2 150 bp) 。PicoPLEX Gold在较低深度的覆盖度与A产品 (MDA) 相似，在较高深度的覆盖度高于A产品（MDA）。
Panel B. 以gDNA样本 (NA12878) 和单细胞样本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A产品进行全基因组扩增。相比较于MDA，PicoPLEX Gold显示出更均匀的覆盖度。
Panel C. 评估覆盖度的重现性。与A产品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在两个单细胞群之间的一致性明显更好。
图3. 使用PicoPLEX Gold进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测。
Panel A. 以单细胞（1c），5个细胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始，比较A产品（MDA），PicoPLEX Gold（PP Gold）和SMARTer PicoPLEX WGA（PP WGA）这3个试剂盒之间的SNV检测率。其中1个和5个细胞的测序深度为35M read pairs， gDNA样品深度为40M read pairs。PicoPLEX Gold（蓝色）有高的保真度和覆盖度，与A产品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比，可以高质量的检测更多的SNV（2-9倍），具有明显的优势。
Panel B. PicoPLEX Gold（蓝色）的B等位基因频率的对称分布，以0.5为中心，展示两个等位基因的平衡情况。与A产品（MDA）相比，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）。
Panel C. PicoPLEX Gold的无偏扩增, 在测试的所有单细胞文库制备的技术中，表现出最低的等位基因脱扣率（假阴性）。
Panel D. PicoPLEX Gold试剂盒中的聚合酶具有高保真度（蓝色），使得等位基因插入率与A产品（灰色）相当，且显著低于PicoPLEX WGA（紫色）。
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Rubicon拥有ThruPLEX 和PicoPLEX 技术。特殊的引物或接头设计，能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。
ThruPLEX DNA-seq Kit
更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina 的 NGS 平台
更高的通量 多达 96 个 index
微量起始样品（50 pg 50 ng），更高性能
快速简单的实验方法：一根管或孔中，仅三步反应，约 2 小时时间，无需转移
适用于所有主要的靶向富集平台 安捷伦 SureSelect Enrichment，罗氏 NimbleGen SeqCap EZ ，IDT xGEN LockDown probes
ThruPLEX Plasma-seq Kit
专为血浆游离DNA设计
专为cfDNA设计：修复及连接试剂配方更新，方法优化
高品质NGS文库：在宽广的GC含量范围内，可以达到高检测再现性
起始量范围广：＜1 ng到30 ng cfDNA量
快速简便：单管、2小时、3步操作步骤，无需纯化或样品转移步骤
应用领域：液体活检、ctDNA、靶向测序等领域文库构建
兼容自动化平台：Beckman FXP Workstation
Takara Clontech NGS系列产品
品牌/生产厂家产品编号产品名称单位Rubicon GenomicsR300381PicoPLEX DNA-seq Kit48RxnsRubicon GenomicsR30050PicoPLEX WGA Kit50RxnsRubicon GenomicsR300644PicoPLEX WGA Kit 500RxnsRubicon GenomicsR300669SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit24RxnsRubicon GenomicsR300670SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit96RxnsRubicon GenomicsR300698SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit384RxnsRubicon GenomicsR300671SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit24RxnsRubicon GenomicsR300672SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit96RxnsRubicon GenomicsR300673SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit480RxnsRubicon GenomicsR400406ThruPLEX DNA-seq 48D Kit48RxnsRubicon GenomicsR400407ThruPLEX DNA-seq 96D Kit96RxnsRubicon GenomicsR400427ThruPLEX DNA-seq 48S Kit48RxnsRubicon GenomicsR400428ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit48RxnsRubicon GenomicsR400490ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit12RxnsRubicon GenomicsR400491ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit48RxnsRubicon GenomicsR400492ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit96RxnsRubicon GenomicsR400523ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit12RxnsRubicon GenomicsR400584ThruPLEX Tag-seq 6S（12）Kit12RxnsRubicon GenomicsR400585ThruPLEX Tag-seq 48S Kit48RxnsRubicon GenomicsR400586ThruPLEX Tag-seq 96D Kit96Rxns欢迎您致电 重庆市华雅干细胞技术有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229
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