雷勃LabsystemsMK3、伯乐Bio-rad680、宝特Elx-800、奥地利安图斯2010、雷杜酶标仪/雷勃LabsystemsMK2、伯乐Bio-rad1575、宝特Elx-50洗板机/日本三洋SANYO(MDF-382E超低温冰箱、MIR-253低温培养箱、MLS-3750高压灭菌器、CO2培养箱)/Shellab(1004分子杂交箱、2306二氧化碳培养箱、WPC65水浴箱)/美国Millipore Q Biocel 纯水系统/德国艾本德eppendorf、大龙、雷勃Labsystems、法国吉尔森Gilson 移液器/德国艾本德eppendorf5415D、德国贺力氏Heraeus Primo R 离心机/美国ABI 2720 9700、德国艾本德eppendorf5332 PCR基因扩增仪/德国Heraeus(贺力氏)BB15、美国REVCO 3000T、美国热电Foma3111 二氧化碳培养箱/梅特勒Mettler Toledo、赛多利斯 分析天平/全系列Bio-rad电泳系统/美国MEDICA全自动电解质分析仪/新加坡ESCO二级生安全柜/意大利Scout 半自动生化分析仪/数码相机型、CCD型 凝胶成像/数码相机型、CCD型 显微成像/ 国产(制冰机、各类实验室培养箱、可见分光光度计、微量荧光检测仪)/各类实验室耗才(吸嘴、离心管、培养板、培养皿、比色皿、培养瓶、酶标板、离心管架、吸嘴盒、封口膜)
运用DGGE搜寻未知突变
DGGE 是基于以下原理,即增加聚丙烯酰胺凝胶内变性剂的浓度会熔解双链DNA 的不同区域。当温度达到zui低熔解度区域的熔解温度Tm 时,DNA 部分熔解,在凝胶中形成迁移率下降的分支分子(Myers et al.1987)。在均一的运行温度(50 65 C)和尿素与甲酰胺线性变性梯度条件下即形成了变性环境。梯度以垂直或平行于电泳方向形成。DGGE 是zui灵敏的突变检测方法,其效率可达99%(Grompe 1993)。DCode 系统通过以下途径优化DGGE:
温度控制模块提供45 70 C 内的一致运行温度 系统可运行2 块16 x 16 cm 凝胶或4 块7.5 x 10 cm 凝胶 可选择的MacMelt 或WinMelt 软件优化了GC 夹及引物的置放DGGE 的两种模式。A ,凝胶的变性梯度方向与电泳方向垂直。从原生乳腺癌种扩增的p53 基因6 号外显子的野生型和突变型等位基因通过垂直DGGE(80V,56 C,2 小时)分离。感谢AL Borresen, Radium Hospital, Oslo, Norway 提供的数据。B ,凝胶的变性梯度方向与电泳方向平行。p53 基因8 号外显子的野生型和突变型等位基因在8%丙烯酰胺:甲叉37.5:1 平行梯度(40 65% 变性剂)凝胶上,1 x TAE 缓冲液, 60 C,150 V,电泳2.5 个小时。左泳道,突变型等位基因;中,野生型等位基因;右,突变型与野生型等位基因。
DGGE分离示意图。所示为一个变性梯度方向与电泳方向垂直的凝胶,以及一个有单个熔解区域的目标序列。野生型和突变型样品加入到制备孔内。在低变性剂浓度时,DNA 片段为双链,但当浓度增加时双链DNA 开始熔解,形成分枝分子。到浓度非常高时,DNA 片段可熔解形成2条单链。
运用DGGE搜寻未知突变
DGGE 是基于以下原理,即增加聚丙烯酰胺凝胶内变性剂的浓度会熔解双链DNA 的不同区域。当温度达到zui低熔解度区域的熔解温度Tm 时,DNA 部分熔解,在凝胶中形成迁移率下降的分支分子(Myers et al.1987)。在均一的运行温度(50 65 C)和尿素与甲酰胺线性变性梯度条件下即形成了变性环境。梯度以垂直或平行于电泳方向形成。DGGE 是zui灵敏的突变检测方法,其效率可达99%(Grompe 1993)。DCode 系统通过以下途径优化DGGE:
温度控制模块提供45 70 C 内的一致运行温度 系统可运行2 块16 x 16 cm 凝胶或4 块7.5 x 10 cm 凝胶 可选择的MacMelt 或WinMelt 软件优化了GC 夹及引物的置放DGGE 的两种模式。A ,凝胶的变性梯度方向与电泳方向垂直。从原生乳腺癌种扩增的p53 基因6 号外显子的野生型和突变型等位基因通过垂直DGGE(80V,56 C,2 小时)分离。感谢AL Borresen, Radium Hospital, Oslo, Norway 提供的数据。B ,凝胶的变性梯度方向与电泳方向平行。p53 基因8 号外显子的野生型和突变型等位基因在8%丙烯酰胺:甲叉37.5:1 平行梯度(40 65% 变性剂)凝胶上,1 x TAE 缓冲液, 60 C,150 V,电泳2.5 个小时。左泳道,突变型等位基因;中,野生型等位基因;右,突变型与野生型等位基因。
DGGE分离示意图。所示为一个变性梯度方向与电泳方向垂直的凝胶,以及一个有单个熔解区域的目标序列。野生型和突变型样品加入到制备孔内。在低变性剂浓度时,DNA 片段为双链,但当浓度增加时双链DNA 开始熔解,形成分枝分子。到浓度非常高时,DNA 片段可熔解形成2条单链。