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微生物过滤是指利用含有微生物的固体颗粒吸收废气中的污染物，再将其转化为无害物质的方法。常用的固体颗粒有土壤和堆肥。过滤装置主要有堆肥滤池、土壤滤池和微生物过滤箱。
微生物过滤也可以指生物膜过滤法，即生物膜法是利用附着生长于某些固体物表面的微生物（即生物膜）进行有机污水处理的方法。
生物膜是由高度密集的好氧菌、厌氧菌、兼性菌、真菌、原生动物以及藻类等组成的生态系统，其附着的固体介质称为滤料或载体。生物膜自滤料向外可分为厌气层、好气层、附着水层、运动水层。生物膜法的原理是，生物膜首先吸附附着水层有机物，由好气层的好气菌将其分解，再进入厌气层进行厌气分解，流动水层则将老化的生物膜冲掉以生长新的生物膜，如此往复以达到净化污水的目的。废水中微生物沿固体（可称载体）表面生长的生物处理方法的统称。因微生物群体沿固体表面生长成粘膜状，故名。废水和生物膜接触时，污染物从水中转移到膜上，从而得到处理。其基本机理见水的生物处理法。
生物膜过滤法机理：
1、滤池中长满生物膜的滤料发挥对悬浮物质的拦截作用，物理筛滤二级处理水中悬浮颗粒
2、滤料上附着微生物膜，可氧化分解二级水中的溶解性有机物质(氮、磷等富营养化物质)，并有一定的硝化作用。
滤法填料
填料是污水生物膜处理法的核心部分，它直接影响到处理效果、投资成本及运作费用。
EPP滤材质轻，浮在滤槽上部，污水流经滤槽内附有微生物的EPP滤材时，进行大颗粒悬浮物的过滤和有机物的分解，可有效去除SS 85%，BOD 82%，下图为日本杰斯比塑料有限公司研发的多孔质EPP填料，也称PEPP，这种填料每一个泡沫粒子都带孔，可以大大提高生物膜的附着面积，而且含有活性炭成分，对污浊物有更好的吸附效果。
微生物限度过滤系统是针对液体样品进行微生物检验用的专业系统，由微生物过滤装置和滤杯组成，配合滤膜使用。
微生物限度过滤系统利用过滤杯和检验仪的泵头的配合将滤膜固定压紧，并用硅胶管将检验仪与抽滤瓶连接，形成一个完整的过滤装置；基于薄膜过滤法原理，通过检验仪内置真空抽气泵负压抽滤，将过滤杯内供试液中的微生物截留在滤膜上，转移滤膜进行培养。
微生物限度过滤应用：
1、食品：饮料、矿泉纯净术的微生物限度检验
2、制药——纯化水、注射用水、原料药、口服液、片剂、胶囊、生物制品等制剂的微生物限度检查
3、疾控：空调水，各种江、河、湖、海的微生物检验
4、化工：各种需要测试微生物的水的检验
5、化妆品：各种用水及产品的微生物检查
微孔陶瓷微生物过滤器在医用和生活用过滤材料领域，用于处理含有细菌和病毒的气体或液体的一种微孔过滤器。
属于医用和生活用过滤材料领域的涉及用于处理含有细菌和病毒的气体或液体的一种微孔陶瓷微生物过滤器。该微孔陶瓷微生物过滤器是以磷酸钙盐微孔陶瓷为过滤媒介的。并可以在作为过滤媒介的磷酸钙盐微孔陶瓷中复合抗生剂。微孔陶瓷微生物过滤器以具有亚微米孔隙结构的磷酸钙盐微孔陶瓷作为过滤媒介，能够有效地过滤流体中含有的细菌和病毒等微生物，复合抗生剂进一步提升产品对微生物的杀灭和抑制细菌和病毒效果。
