数字PCR

数字PCR | 基于EVAGREEN 方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测 点击次数：16 发布日期：2019-5-20 来源：本站 仅供参考，谢绝转载，否则责任自负
基于EVAGREEN 方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测
EvaGreen 是一种无致突变性、无细胞毒性的DNA结合染料，NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统可兼容EvaGreen 染料进行的数字PCR实验分析。
反应体系中游离的的EvaGreen 染料不发出荧光信号，但与双链DNA（dsDNA）结合后会发出很强的荧光。NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统使用检测参比荧光（荧光素钠盐）相同的滤光片可进行EvaGreen 染料荧光信号的检测。
使用NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统，EvaGreen 可以通过使用简单的引物来实现靶标绝对定量。使用我们的Sapphire芯片、基于EvaGreen 的方法可检测低至0.2copies/ L。

图1：基于EvaGreen 染料方法的基因组DNA绝对定量

对未进行片段化的人基因组DNA进行倍比稀释，浓度范围从1000-0.2copies/ L，使用NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统进行绝对定量，使用1.5XEvaGreen ，1XPerfeCTa @ UNG Tough mix，扩增片段大小为104bp的EGFR基因片段。为了保证重复性和稳定性我们进行了三次重复（R2= 0.9977）。在NTC（无模板对照）孔中没有观察到阳性微滴。
EVAGREEN 核酸绝对定量实验的建立
当使用EvaGreen 方法进行数字PCR实验时，需要注意，加入PCR mix的模板dsDNA浓度过高将导致较高的背景荧光。此外，EvaGreen 染料与dsDNA具有较高的亲和力，但同时也与存在mix中的寡核苷酸有较低的亲和力，导致背景荧光的增加。 
根据您所需定量的DNA类型和数字PCR反应体系，需要预估实际的动态范围。有关如何建立EvaGreen 实验的更多信息，可登录我们网站 http://stillatechnologies.com。

图2：EvaGreen 绝对定量散点图

对未片段化的人类的基因组DNA进行倍比稀释后，浓度范围1000-0.2copies/ L，使用NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统进行绝对定量，使用1.5XEvaGreen ，1XPerfeCTa @ UNG Tough mix，扩增片段大小为104bp的EGFR基因片段。

灰色点：阴性微滴，蓝色点：阳性微滴。

RFU：相对荧光强度。

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