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北京市农林科学院蔬菜研究中心为北京市属农业科研机构。主要任务是立足北京，面向全国，瞄准世界蔬菜科技发展的前沿，为中国蔬菜产业的高效可持续发展提供技术支撑，重点研究解决蔬菜产前、前中、产后的关键性的技术问题，进行理论与技术创新，同时进行多学科的综合配套研究与集成，并实现科研成果的产业化，带动我国蔬菜产业的升级。
“中心”实行主任负责制和首席专家技术责任制，建立研究开发主体与经济实体相互依存的体制模式。“中心”下设九个研究室，即：蔬菜种质资源与特菜引种研究室;蔬菜生物技术研究室;耐寒类蔬菜育种研究室;茄果类育种研究室;瓜类育种研究室;花卉研究室;蔬菜栽培与设施研究室;蔬菜采后保鲜与加工研究室;蔬菜种子与产品质量检测研究室。建立了四个跨学科综合实验室，即：北京蔬菜种质改良实验室;蔬菜活性物质与深加工实验室;资源高效利用实验室和都市园艺与设施实验室。
“中心”下设四个实验农场，即：中心试验农场;四季青试验农场;延庆原种繁育农场及海南试验农场。此外，还有以“中心”为依托的农业部蔬菜种子质量检测监督中心。“中心”投资兴办的北京京研益农科技发展中心、北京利得农业科技开发公司、北京京域威尔农业科技有限公司三个经济实体。
