显微镜下金葡菌基因组DNA提取的技巧

显微镜下金葡菌基因组DNA提取的技巧
一、组织抽提：

1. 显微镜下取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末
2. 移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打
3. 移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆
4. 冰上孵育5分钟
5. 离心12,000g 4℃ 5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管
6. 加0.2 ml氯仿，震荡，冰上孵育5分钟
7. 离心 12,000g 4℃ 10分钟 取上层液相移入1.5ml新离心管
8. 加0.5 ml异丙醇，震荡，冰上孵育5分钟
9. 离心 12,000g 4℃ 5分钟 弃去上清液
10. 加入1 ml 75%乙醇，震荡
11. 离心 7,500g 4℃ 5分钟 弃去上清液
12. 室温下使之变透明
13. 加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA（ 可保存在液氮或低温冰箱）
14. 走RNA变性电泳观察18s，28s条带，分光光度计检测260/280吸光度比值，计算RNA浓度

二、RT反应体系（第一步）：约20分钟
RNA 抽提物
5μl
Radome 引物
2μl
RNA sin
0.5μl

1. 65℃ 15分钟
2. 立即放入冰浴
RT反应体系（第二步）：约2小时
RNA sin
0.5μl
10mM dNTP
1μl
5×RT 缓冲液
4μl
25mM MgCl2
4μl
AMV 逆转录酶
3μl

1. 37℃ 1.5小时
2. 94℃ 5-10分钟

3. 反应物保存于-20℃或进行PCR

三1、PCR反应体系：约4.5小时

25mM MgCl2
2μl

10×PCR 缓冲液
5μl

10mM dNTP
1μl

上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2

CDNA模板
2.5μl

ddH2O
34μl

Taq酶
0.5μl

轻质石蜡油
50μl

100μl

1. 94℃ 2分钟，55℃ 1分钟，72℃ 2分钟 为第一个步1个循环

2. 94℃ 45秒，55℃ 40秒，72℃ 1分钟 为第二步30个循环

3. 72℃ 10分钟

4. 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳

三2、PCR反应体系：约5小时

25mM MgCl2
3μl

10×PCR 缓冲液
5μl

10mM dNTP
1μl

上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2

CDNA模板
5μl

ddH2O
30μl

Taq酶
1μl

轻质石蜡油
50μl

100μl

1. 94℃ 2分钟，55℃ 1分钟，72℃ 2分钟 为第一个步1个循环

2. 94℃ 45秒，50℃ 40秒，72℃ 1分钟 为第二步40个循环

3. 72℃ 10分钟

4. 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳

四、电泳：约1.25小时

1. 配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml

2. 胶浓度1.7%（40ml 0.5×TBE加0.68g胶）

3. 微波炉中火2分钟溶解胶

4. 冷却至60℃加入溴乙锭2μl（10mg/ml的终浓度0.5μg/ml）

5. 放入梳子，浇板，待凝固

6. 加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰

7. 电泳50-80V（每㎝ 5V）

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