先前称为TruSeq Stranded mRNA文库制备试剂盒(目录号RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的产物现称为TruSeq Stranded mRNA。产品配置已更改。在新配置中,库准备和索引适配器可以单独购买。
产品名称:TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)
(附推广:RNA相关产品,如有需求,请在推文中查询;更多产品,欢迎咨询)
产品货号:20020594(ssv21106)
产品规格:
分析时间 ~10.5小时
动手时间 ~4.5小时
输入数量 0.1 - 1 ug总RNA或10 - 100 ng以前分离的mRNA(来自具有polyA尾的物种)
内容规格 用链信息捕获编码转录组
行动机制 Oligo-dT珠子捕获polyA尾巴
复 1-96
描述 通过精确的链信息为研究人员提供清晰,全面的编码转录组视图。
专业样品类型 不兼容FFPE
物种详情 使用来自任何具有polyA尾巴的物种的高质量RNA
系统兼容性 Genome Analyzer IIx,HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000,HiSeq 2500,HiSeq 3000,HiSeq 4000,MiSeq,NextSeq 500,NextSeq 550,NovaSeq 6000
变体类 基因融合,新型转录本,单核苷酸多态性(SNPs),转录变体
物种类别 哺乳动物,大鼠,人类,牛,老鼠
核酸类型 RNA
技术 测序
方法 mRNA测序
线条特异性 搁浅
产品名称:TruSeq Stranded mRNA文库制备(48样本)测序 产品货号:20020594(ssv21106)
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欢迎您的致电 400 021 2200 150 2101 0459
红荣微再(上海)生物工程技术有限公司
产品介绍:TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了简化,经济高效且可扩展的解决方案。它与各种样品兼容。
钢绞线方向检测
获得mRNA链方向的精确测量,用于检测反义转录,增强的转录物注释和增加的比对效率。高覆盖度均匀性增强了诸如替代转录物,基因融合和等位基因特异性表达等特征的发现。
成本效益
链状信息识别来自给定RNA转录物的2条DNA链中的哪一条。该信息提供了对转录物注释的增强的置信度,特别是对于非人类样品。鉴定链来源增加了比对的读数百分比,降低了每个样品的测序成本。
可扩展
该工作流程可以对标准样品和低质量样品进行可靠的询问,并且工作流程与各种研究设计兼容。
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文库制备
品牌 产品货号 产品名称
illumina品牌 20020594 TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)文库制备
illumina品牌 20020595 TruSeq Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)文库制备
引物接头
品牌 产品货号 产品名称
illumina品牌 20020492 TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)引物接头
illumina品牌 20020493 TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)引物接头
illumina品牌 20019792 TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)引物接头
illumina品牌 20020591 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)引物接头
illumina品牌 20022371 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)引物接头
配件产品
品牌 产品货号 产品名称
illumina品牌 20024144 Illumina Free Adapter Blocking Reagent (12 reactions)配件产品
illumina品牌 20024145 Illumina Free Adapter Blocking Reagent (48 reactions)配件产品
文库制备试剂盒
品牌 产品货号 产品名称
illumina品牌 RS-122-2101 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set A (48 samples, 12 indexes)文库制备试剂盒
illumina品牌 RS-122-2102 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set B (48 samples, 12 indexes)文库制备试剂盒
illumina品牌 RS-122-2103 TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit High Throughput (96 samples, 96 indexes)文库制备试剂盒
Illumina二代测序技术,边合成边测序(SBS),是全球广泛采用的新一代测序(NGS)技术,负责产生世界上90%以上的测序数据。
Illumina的二代测序技术称为边合成边测序(Sequencing-by-Synthesis,简称SBS)。SBS主要包括碱基延伸、荧光激发及信号收集、剪切等3个步骤。这3个步骤可以重复,循环进行。每循环一次测定一个碱基。想测定多少个碱基(即读长),就循环多少次。测序循环次数可以在软件里设定。到底测序多长合适,要根据项目性质和需求来决定。大多数情况下,SR实验(单端测序)测定1x50个碱基,PE实验(双端测序)测定2x150个碱基。
1 碱基延伸
Illumina测序试剂里所使用的dNTP特色,它们同时具有两个修饰基团:一个荧光基团,一个可逆终止基团。A、G、C、T 4种碱基分别标记4种不同的荧光基团,它们在不同波长的激光激发下,能够发射不同波长(即颜色)的荧光。荧光颜色与碱基种类一一对应,因此根据激发光的波长可以识别碱基。4种碱基的终止基团是一样的。由于终止基团的存在,所有dNTP每次都只能延伸1个碱基,无论给予多长的反应时间。又由于该终止基团是可逆的,在荧光信号收集完毕之后,可以用剪切剂切除该终止基团,使碱基恢复自然的可延伸状态,这时即可继续进行下一轮循环,再测定一个碱基。
可逆终止基团技术是Illumina二代测序的一大特色。它与桥式PCR技术一起,构成了Illumina二代测序的两大支柱,为稳定获得高质量的测序数据打下了坚实的基础。
2 信号采集
HiSeq系列测序仪具有红绿两根激光管,两个滤色片。它们两两组合,可以形成4种不同的激发波长,正好分别用于激发A、G、C、T 4种碱基。
Cluster上所标记的荧光基团在激光激发下产生的信号,可以用相机拍摄或者扫描的方式收集信号。扫描技术速度比较快,被X10系列采用。由于FC面积比较大,而且上表面和下表面要分别拍照,所以拍照过程相当耗时。对于经典的HiSeq 2000来说,一次测序循环所产生的荧光信号,需要大约40分钟的时间才能拍照收集完毕,时间比测序反应本身还要长。
3 剪切
荧光信号收集完毕后,关闭激光,用剪切剂去除测序引物的延伸产物上的碱基所标记的荧光基团和终止基团。两个修饰基团均被切除,一方面消去干扰荧光,一方面使链末端的碱基回复到自然的可延伸状态,为下一轮测序做好准备。
再重复合成、激发、收集等步骤,即可进行第二个碱基的测序。
测序循环可以重复多次。理论上可以一直重复,直到信噪比降低得无法有效识别碱基信号为止。由于荧光基团的发光效率持续不断在衰减,Taq酶的活性也在持续不断地衰减,所以实际上测序循环次数是有限的,最大重复次数与sbs试剂的配方有关。测序的循环次数可以在软件设置过程中人为指定,这个重复次数就是每个测序片段的读长。目前,Illumina平台的读长有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多种,其中2x150 bp用得较广泛。
单端测序:单端测序(Single-read)首先将DNA样本进行片段化处理形成200-500bp的片段,引物序列连接到DNA片段的一端,然后末端加上接头,将片段固定在flow cell上生成DNA簇,上机测序单端读取序列。
双端测序:双端测序(Paired-end)方法是指在构建待测DNA文库时在两端的接头上都加上测序引物结合位点,在*轮测序完成后,去除*轮测序的模板链,用对读测序模块(Paired-End Module)引导互补链在原位置再生和扩增,以达到第二轮测序所用的模板量,进行第二轮互补链的合成测序。
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。
基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术 。
基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。
基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要采集孕妇的外周血,通过对血液中游离DNA(包括胎儿游离DNA)进行测序,并将测序结果进行生物学分析,从而得出胎儿是否患有染色体数目异常的疾病,包括常见的21-三体综合征(唐氏综合征)、18-三体综合征(爱德华氏综合征)和13-三体综合征(Patau综合征)。
附推广:illumina品牌 RNA相关产品:
品牌 产品货号 产品名称
illumina品牌 RS-200-1001 TruSeq RNA EPH Reagent Tube
illumina品牌 RS-303-1002 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A
illumina品牌 RS-303-1003 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B
illumina品牌 RS-304-1002 TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)
illumina品牌 RS-304-1003 TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)
illumina品牌 RT-101-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-102-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-201-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-202-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-801-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-802-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (96 samples)
illumina品牌 RZE1224 Ribo-Zero? rRNA Removal Regents (Epidemiology) 24 Reactions
illumina品牌 RZH110424 Ribo-Zero? rRNARemoval Kit (H/M/R) 24rxns
illumina品牌 RZHM11106 Ribo-ZeroTM Gold rRNA Removal Reagents (Human/Mouse/Rat)
illumina品牌 RZMB12324 Ribo-Zero? rRNA Removal Reagents (Bacteria) 24 Reactions
illumina品牌 RZNB1056 Ribo-Zero rRNA-Removal Reagents (Gram-Negative Bacteria) 6 Rxns
illumina品牌 RZPL11016 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Leaf) 6 Rxns
illumina品牌 RZSR11036 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Seed/Root) 6 Rxns
illumina品牌 T4RL2DML-X T4 RNA Ligase 2, Deltion Mutant-Bulk
illumina品牌 T7R100UML-X T7 RNA Polymerase (100 U/ul)-Bulk
illumina品牌 T7R1KUML-X T7 RNA Polymerase-Bulk; 1,000 U/ul
illumina品牌 T7R50UML-X T7 RNA Polymerase (50 U/ul) - Bulk
illumina品牌 TAB1R80524 TargetAmp 1-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 105 24 Rxns
产品名称:TruSeq Stranded mRNA文库制备(48样本)测序 产品货号:20020594(ssv21106)
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