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molecularCPU与molecular数据分析

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放大字体  缩小字体    发布日期:2021-01-25  来源:仪器网  作者:Mr liao  浏览次数:60
核心提示:微阵列芯片与微阵列分析 我们在微阵列芯片制作与应用过程中,常涉及到微阵列分析。与DNA顺序分析和基因分型不同,微阵列基因表达分析的分析物是信使RNAs。信使RNAs的不稳定性要比RNA大得多,对操作要求非常高,以避免由于Rnase酶降
微阵列芯片与微阵列分析

我们在微阵列芯片制作与应用过程中,常涉及到微阵列分析。与DNA顺序分析和基因分型不同,微阵列基因表达分析的分析物是信使RNAs。信使RNAs的不稳定性要比RNA大得多,对操作要求非常高,以避免由于Rnase酶降解二产生假象。在大多数微阵列分析中,都是逆转录形成cDNA的。


微阵列用于细胞遗传学分析


细胞遗传学分析微阵列检测


用于全基因组分析的完整微阵列和试剂盒。微阵列通常用于检测结构性变异并准确分析导致疾病的染色体畸变。我们的微阵列和试剂盒提供稳健而可靠的低通量和高通量处理方法。


CytoScan 细胞遗传学套件提供平衡的全基因组覆盖


与其他由于探针密度、重现性和放置受限而缺乏获得真正平衡的全基因组覆盖能力的探针相比,CytoScan 细胞遗传学套件阵列提供多态性与非多态性探针的Z佳平衡,以实现细胞遗传学应用的全面覆盖。




微阵列可用作转录组谱分析


表型异常很少是单个基因表达变化的结果,因此,在研究正常生物学过程和疾病过程时,生成全面的表达谱至关重要。此外,重要的表达改变,如选择性剪接事件导致的差异性外显子使用,则可能在进行基因水平谱分析时被遮盖。微阵列提供了同时检测上百万个不同序列的极大优势,这使得该技术不会受到检测和测量低丰度转录本或罕见选择性剪接事件中所遇问题的影响。


Clariom 和 GeneChip 阵列能够通过专为测量转录组多聚腺嘌呤组分的 3’端而设计的阵列和检测提供编码和非编码基因的广泛覆盖范围,或者通过专为测量多聚腺嘌呤和非多聚腺嘌呤转录本的全转录本而设计的检测和阵列提供整个基因的所有转录外显子的覆盖范围。


Affymetrix 全转录本分析方法让研究人员不仅能检测到表达水平,还能检测到表达内容,包括替代同种型或基因组缺失。这为采用经典的基于 3’端的微阵列无法解决的问题提供了解决方案的新见解。


Clariom D 检测可详细显示转录组细节视图,采用Z快路径得到可操作结果。Clariom D 分析可用于人类、小鼠和大鼠,让转录研究科学家快速而简单地得到高保真度的生物标记物签名。创新 Clariom D 检测设计用于提供Z为复杂的全转录组范围基因水平和外显子水平的表达谱,包括在一项为期三天的实验中,检测编码和长链非编码 (Inc) RNA 的选择性剪接事件


利用微阵列的拷贝数分析


微阵列是检测诸如染色体插入、重复和缺失等 DNA 结构变异 (SV) 的shou选平台。除了这些拷贝数变异 (CNV),同时覆盖多态性 (SNP) 区域和非多态性区域的全基因组阵列还可额外检测到提示杂合性缺失 (AOH)、杂合性丢失 (LOH) 或纯合性过长连续延伸 (LCSH) 的染色体不平衡和等位基因失衡。


基于微阵列检测的优势:


涵盖目前已确立为重要的基因以及有新出现证据支持的基因的全基因组覆盖范围

检测灵敏度高:用于阐明克隆进化模式的低水平嵌合、异质样本、结构不一致和 gDNA 或细胞污染

灵活的工作流程:用于经济实惠地手动或自动处理数份至上千份样本。

高质量、可重现的数据,便于集成并与公共数据库和合作方资源对比。

从送样到出结果的周转时间迅速,包括数据分析在内仅需 2 到 3 天


利用微阵列芯片的人类基因分型


Axiom™ 基因分型解决方案提供了可定制阵列或预设计阵列的独特灵活选择,其填补设计覆盖的种群范围超过其他任何一种技术。专有的光刻阵列帮助确保生产批次间的保真度和一致性,按用户需要保持设计长时间可用。所有阵列可访问填补优化后的设计,可将 GWAS、复制和精细定位结合在同一项研究中。它是唯yi一种可提供 1000 万余种经传统分子生物学实验室验证且完全注释的标记物选项的基因分型解决方案,由此研究人员可轻松而经济实惠地为其应用创建优化后的阵列设计。


微阵列芯片和GBS的农业基因组学解决方案


Affymetrix 农业基因组学基因分型解决方案为育种人员和研究人员提供了强大的基因分型工具和灵活的范围,以便高效地验证、识别、筛选植物和动物中的复杂遗传性状。稳健的、可重现性高、可扩展的产品系列,有助于标记辅助选育、全基因组关联研究、数量性状位点分析、亲子代关系和可追溯性,这些都将为您快速追踪基因组选择程序提供帮助。


2018-05-09 3243次

 
 
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